Педагогический музей им. А. С. Макаренко осуществляет свою деятельность в составе Государственного образовательного учреждения "Центр внешкольной работы имени А.С. Макаренко" (ЦВР им. А.С. Макаренко), образованного Московским департаментом образования 30 июня 1992 года (приказ №315) на месте существовавшего по решению Госкомтруда (1983 г.) Педагогического музея А.С. Макаренко. Педагогический музей А.С. Макаренко решает следующие культурно-просветительские задачи:
• приобщение широких кругов населения к новому, более точному и выверенному на научной основе пониманию опыта А.С. Макаренко в воспитании, просвещении, предпринимательстве, писательстве, театрально-культурной, туристической деятельности, восстановлении и укрепления правопорядка и т.д.;
• возрождение в общественном мнении понимания коллектива как главного средства общественного воспитания, способного гармонизировать взаимоотношения личности и общества; содействие распространению в воспитательной практике производительного труда, всех видов продуктивной занятости детей и молодёжи;
• превращение Педагогического музея А.С. Макаренко в один из культурных центров Москвы.